Стефаниевская церковь является частью архитектурного ансамбля Мирожского монастыря XII в., включенного в список культурного наследия ЮНЕСКО. В летописи значится, что в 1404 году игумен Карп поставил в Спасо-Мирожском монастыре каменную церковь св. Стефана. Позднее она была перестроена в стиле московского зодчества. Мирожский монастырь –действующий, мужской. Монастырская жизнь в нем возобновилась в 1994 г., после более чем 70-летнего перерыва. Тогда же была создана мирожская международная иконописная школа, которую возглавил архимандрит Зинон (Теодор). Храмовый иконостас представляет собой уникальные фресковые росписи работы архимандрита Зинона. При монастыре работают иконописные мастерские. В подклете Стефановского храма оборудована выставка современной иконы.
Стефаниевская церковь входит в программу реставрации АНО «Возрождение». Проект реставрации прошел согласование методического совета Министерства культуры РФ. Включает раскрытие святых врат со стороны Стефаниевской церкви, воссоздание решеток, святых врат, реставрацию и воссоздание утраченных элементов декора церкви. Работы начнутся уже в 2021 году. Проект реставрации Мирожского монастыря включает проведение системы водотведения, строительство инженерных сетей: отопления, канализации, подведение водопровода. Все работы делаются с учетом мнения пользователей их два: Псковская епархия и Псково-Изборский музей-заповедник. Предусмотрены работы по планировке территории: установка фонарей, посадка деревьев и кустарников, устройство дорожек, которые будут разделять поток туристов и паломников. Работы будут продолжаться 3 года.